1. STR背景
近年来,ATCC、DSMZ、JCRB等国际知名细胞库已将STR基因分型列为细胞鉴定的金标准。
短串联重复序列(STR)也称为微卫星标记(Microsatellite),是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。其核心序列(长度为1~6个碱基)重复次数存在个体差异多态性,因此STR也被称为细胞的DNA指纹。它具有多态性高、稳定可靠等特点,因此是一种十分理想的分子标记。
2. 流程
①若有相近种属STR位点资料,从有关数据库(GenBank, EMBL DDBJ等)或文章中查询现成STR位点;
若无相近种属STR位点借鉴需构建基因组文库
②筛选STR位点
③获得引物
④PCR扩增
⑤凝胶电泳
⑥荧光引物PCR
⑦STR测序(ABI 进行毛细管电泳)
⑧数据处理
3. 特点
①STR在真核生物基因组中分布广、多态性丰富;
②其产物进行测序胶电泳分离时单碱基分辨率高、遗传信息量大;
③STR具有很好的稳定性和多态性,DNA用量少,技术要求低,成本低廉,PCR扩增的可重复性高。
4. 应用
①亲缘关系鉴定
②个体识别
③基因定位
④细胞来源判定
⑤构建遗传图谱
⑥群体间遗传距离分析
⑦进化和遗传多样性研究
⑧遗传标记选择
⑨建立DNA指纹
⑩用于品种鉴定
⑪利用标记辅助选择,加快育种速度
5. 服务结果展示
①DNA提取定量结果(Qubit定量)
②DNA琼脂糖凝胶电泳结果
③STR测序结果及分析
④样本遗传同一性与遗传距离
⑤样本亲缘关系树状图
6. 你一定选择我们的理由
①服务态度
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③结果可信度高
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