STR/SSR生物进化分析

STR/SSR生物进化分析

1. STR背景

近年来,ATCC、DSMZ、JCRB等国际知名细胞库已将STR基因分型列为细胞鉴定的金标准。

短串联重复序列(STR)也称为微卫星标记(Microsatellite),是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。其核心序列(长度为1~6个碱基)重复次数存在个体差异多态性,因此STR也被称为细胞的DNA指纹。它具有多态性高、稳定可靠等特点,因此是一种十分理想的分子标记


2.  流程

①若有相近种属STR位点资料,从有关数据库(GenBank, EMBL DDBJ等)或文章中查询现成STR位点;

  若无相近种属STR位点借鉴需构建基因组文库

②筛选STR位点

③获得引物

④PCR扩增

⑤凝胶电泳

⑥荧光引物PCR

⑦STR测序(ABI 进行毛细管电泳)

⑧数据处理


3.  特点

STR在真核生物基因组中分布广、多态性丰富;

②其产物进行测序胶电泳分离时单碱基分辨率高、遗传信息量大;

③STR具有很好的稳定性和多态性,DNA用量少,技术要求低,成本低廉,PCR扩增的可重复性高


4.  应用

亲缘关系鉴定

②个体识别

③基因定位

④细胞来源判定

⑤构建遗传图谱

⑥群体间遗传距离分析

⑦进化和遗传多样性研究

⑧遗传标记选择

⑨建立DNA指纹

⑩用于品种鉴定

利用标记辅助选择,加快育种速度


5.  服务结果展示

①DNA提取定量结果(Qubit定量)  


②DNA琼脂糖凝胶电泳结果


③STR测序结果及分析



④样本遗传同一性与遗传距离

⑤样本亲缘关系树状图


  6. 你一定选择我们的理由

     ①服务态度

       认真严谨,团结友爱,一致为科研,一心为服务

     ② 操作规范严谨

     ③结果可信度高

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